Vervolgens kwamen de Malla’s aan het bewind, rechtstreekse afstammelingen van de hindoevorsten uit Rajasthan (India), die voor de islam op de vlucht waren geslagen. De belangrijkste Malla-koning was Yaksha Malla. Deze koning liet na zijn dood in 1480 zijn rijk na aan zijn vier kinderen. Deze kinderen verdeelden de vallei in vier stukken. Na een korte periode bleven er drie koninkrijkjes over: Kantipur (Kathmandu), Bhaktapur (Bhadgaon) en Lalitpur (Patan). Het koninkrijkje Kirtipur was slechts een kort leven beschoren. In deze periode bereikte de Newarcultuur een ongekende hoogte. Ook ontstonden toen de architectonische kunstwerken, die wij thans nog in al hun pracht kunnen bewonderen.