Vooral op Lake Edward zijn goede ferryverbindingen tussen diverse plaatsen. Vanuit Panyimur aan de noordzijde van het meer kunt u, behalve de overtocht naar een van de Ugandese plaatsen langs het meer, zelfs (als het even meezit) R.D. Congo bereiken. De Ssese eilanden zijn bereikbaar vanuit Nakiwogo nabij Entebbe en vanuit Bukakata, oostelijk van Masaka. Beide verbindingen brengen u op het belangrijkste eiland van de archipel: Buggala. In 2010 is het aantal ferries naar deze eilanden aanzienlijk uitgebreid.